More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0794 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
312 aa  641    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.49 
 
 
310 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.49 
 
 
310 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.6 
 
 
314 aa  328  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  50.99 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  50.66 
 
 
312 aa  323  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.67 
 
 
310 aa  318  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.33 
 
 
309 aa  315  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 
510 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 
346 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
328 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.23 
 
 
724 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
501 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 
319 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
459 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
312 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.23 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.59 
 
 
315 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
322 aa  136  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
368 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
349 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.65 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
312 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
342 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
338 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
315 aa  119  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  28.76 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.76 
 
 
344 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
321 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
342 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  27.27 
 
 
353 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
346 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
325 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
353 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
346 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
349 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
336 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
348 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
352 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
347 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  25.47 
 
 
326 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
316 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
369 aa  85.9  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000594661  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  29.69 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  29.69 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  28.63 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  28.93 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.82 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.65 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  27.07 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.55 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.36 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  25.29 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.850459  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  24.92 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152029  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
351 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>