More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1073 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1073  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 345 aa  704    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.688029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.78 
 
 		 322 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.31 
 
 		 332 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.377731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.61 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5669  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869127 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  28.32 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  30.7 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 304 aa  99.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0337048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  28.72 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  28.83 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  28.88 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  26.45 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  26.45 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.37 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.13 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  25.62 
 
 		 328 aa  93.6  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  27.99 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  27.79 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  29.12 
 
 		 332 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  29.14 
 
 		 339 aa  92.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  28.71 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  28.06 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  28.82 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  27.01 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  27.49 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  28.18 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.37 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  28.18 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.11 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0958  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.384562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  28.13 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.01 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.01 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.64 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.88 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  29.56 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.01 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  32.47 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 		 328 aa  90.1  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 		 306 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  28.27 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 299 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  27.33 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 317 aa  89.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  30.79 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  27.78 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 292 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 		 296 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  26.59 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  26.9 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  26.89 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  28.32 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  29.31 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  26.64 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.89 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  31.35 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  27.43 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  26.57 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  28.72 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  28.31 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  27.63 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  26.43 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>