More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2349 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.34 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  49.49 
 
 
297 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.46 
 
 
294 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.65 
 
 
294 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  50.17 
 
 
297 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  50.17 
 
 
297 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
297 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.89 
 
 
297 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.6 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.6 
 
 
296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.6 
 
 
296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.6 
 
 
296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.52 
 
 
296 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.8 
 
 
293 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.58 
 
 
307 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.26 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 
296 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 
297 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  45.45 
 
 
303 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.49 
 
 
297 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.05 
 
 
296 aa  258  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  49.16 
 
 
297 aa  254  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.51 
 
 
293 aa  248  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.36 
 
 
292 aa  245  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.1 
 
 
299 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.15 
 
 
302 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.67 
 
 
298 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.12 
 
 
323 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.36 
 
 
295 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.91 
 
 
298 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.57 
 
 
295 aa  235  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.33 
 
 
301 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.71 
 
 
328 aa  231  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  41.67 
 
 
297 aa  229  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.43 
 
 
292 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  41.33 
 
 
295 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.1 
 
 
294 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 
295 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.02 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  39.06 
 
 
301 aa  211  7.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.9 
 
 
321 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
323 aa  208  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
321 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  31.44 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
307 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
291 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
301 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
312 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.52 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  26.14 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
298 aa  85.5  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  26.78 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.26 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  38.89 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.98 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  28.88 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 
330 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  27.9 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.28 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.94 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  30.77 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  37.5 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.28 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  23.99 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.9 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  42.59 
 
 
619 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  35 
 
 
332 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  38.89 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 
332 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.43 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.44 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  36.11 
 
 
329 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>