More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4398 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
337 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.54 
 
 
354 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.55 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.55 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.55 
 
 
329 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.26 
 
 
347 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.24 
 
 
329 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.63 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
341 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.87 
 
 
336 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.18 
 
 
343 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13757  oxidoreductase  42.8 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.142095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5194  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
316 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524902  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
342 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
339 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  30.33 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0770321  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
322 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
322 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  30.38 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.56 
 
 
340 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
347 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
352 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  31 
 
 
329 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  30.03 
 
 
328 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
349 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  31.14 
 
 
329 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.33 
 
 
334 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
355 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  29.27 
 
 
328 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
358 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 
328 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
330 aa  93.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
348 aa  92.8  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
329 aa  92.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6145  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32 
 
 
341 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804381  normal  0.0679863 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
332 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.54 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.6 
 
 
329 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  29.15 
 
 
340 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  30.28 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.61 
 
 
327 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  27.17 
 
 
354 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  32.44 
 
 
333 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  27.91 
 
 
329 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
329 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  27.91 
 
 
329 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  31.23 
 
 
340 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
331 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
331 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  27.61 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.51 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  29.45 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  29.22 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  29.22 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.89 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.89 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.58 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.72 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  27.12 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  29.08 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  26.06 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>