More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2955 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
332 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.06 
 
 
348 aa  342  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0351849  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
326 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.91 
 
 
322 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 
320 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 
333 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
333 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01625  dihydroflavonol 4-reductase family protein  34.03 
 
 
333 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.84 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
333 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
331 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  31.15 
 
 
338 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.75 
 
 
331 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  30.61 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
333 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  30.46 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
328 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
392 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
332 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  28.66 
 
 
328 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
328 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
355 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  30.48 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  28.62 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  31.35 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.44 
 
 
329 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  28.05 
 
 
329 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  26.77 
 
 
329 aa  116  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  29.34 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  31.5 
 
 
333 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
358 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  31.83 
 
 
329 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
361 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
355 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
330 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  26.85 
 
 
329 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  26.85 
 
 
329 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  29.79 
 
 
329 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  29.79 
 
 
329 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
322 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.81 
 
 
327 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
324 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
339 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
347 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
324 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
322 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  31.11 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  30.94 
 
 
335 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.4 
 
 
335 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  30.04 
 
 
336 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  28.79 
 
 
335 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
329 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  26.56 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.48 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  25.88 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.09 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.49 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  28 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
319 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  27.41 
 
 
328 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10140  oxidoreductase  25.15 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
342 aa  87  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  30.04 
 
 
336 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.78 
 
 
338 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.78 
 
 
338 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.78 
 
 
335 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  26.03 
 
 
340 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
334 aa  85.9  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.3 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.84 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>