More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3249 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
339 aa  675    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 
340 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 
340 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.25 
 
 
347 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.83 
 
 
347 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  32.15 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
328 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
330 aa  146  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  32.84 
 
 
329 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
361 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  31.85 
 
 
363 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
328 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.62 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  33.13 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
331 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  32.54 
 
 
329 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  32.25 
 
 
329 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.33 
 
 
327 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  30.91 
 
 
329 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  31.04 
 
 
328 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  30.91 
 
 
329 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
331 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.41 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
355 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
333 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  30.33 
 
 
329 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
328 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  31.45 
 
 
329 aa  132  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  31.45 
 
 
329 aa  132  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  29.91 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.74 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
358 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
329 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.65 
 
 
334 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  29.34 
 
 
340 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
332 aa  122  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  31.4 
 
 
354 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
324 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  29.08 
 
 
333 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.73 
 
 
330 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
326 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.25 
 
 
322 aa  116  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
339 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  29.97 
 
 
349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
358 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1550  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205711  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
330 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  30.74 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.64 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 
329 aa  110  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  28.28 
 
 
332 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
329 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
329 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
320 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
341 aa  109  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
329 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01625  dihydroflavonol 4-reductase family protein  26.69 
 
 
333 aa  108  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.01 
 
 
335 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.31 
 
 
338 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
346 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
329 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
333 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.01 
 
 
335 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.01 
 
 
335 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.31 
 
 
338 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.31 
 
 
338 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 
341 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
352 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
347 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
338 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
349 aa  106  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
336 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
336 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  28.08 
 
 
335 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  28.53 
 
 
345 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  29.72 
 
 
329 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  26.73 
 
 
341 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.91 
 
 
376 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  27.71 
 
 
336 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  28.08 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
335 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.41 
 
 
338 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  28.08 
 
 
335 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
335 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
335 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  26.73 
 
 
341 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
329 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>