More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1550 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1550  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 357 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.7 
 
 		 341 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6145  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.8 
 
 		 341 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804381  normal  0.0679863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  38.79 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  38.34 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.54 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  38.79 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.2 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 		 328 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  37.73 
 
 		 329 aa  173  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  39.01 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  36.34 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  33.74 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  33.74 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.61 
 
 		 355 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.66 
 
 		 329 aa  169  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  39.01 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  37.13 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.53 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  37.77 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  36.84 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  36.53 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  37.23 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  37.85 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.77 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  39.09 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  36.53 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  37.35 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  36.53 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  36.53 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  37.54 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  37.54 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  37.54 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  37.54 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  37.23 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  34.77 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.54 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.54 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.53 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  34.78 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  36.47 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  38.52 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  36 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  35.09 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  36.22 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  36.22 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  34.37 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 		 347 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  30.65 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  33.13 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 		 392 aa  123  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.74 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  30.91 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.22 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.01 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.86 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 343 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  29.91 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 		 339 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 		 352 aa  96.3  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.4 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 338 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  29.38 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>