More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0793 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  100 
 
 		 331 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  78.25 
 
 		 331 aa  551  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  70.39 
 
 		 338 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.07 
 
 		 331 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.67 
 
 		 330 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.58 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.46 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.89 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 		 341 aa  192  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  33.94 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  33.54 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  32.92 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  32.92 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  33.23 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  34.85 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  34.85 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  32.74 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  31.52 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  30.95 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  30.06 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.33 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.33 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.33 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.33 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.33 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  30.33 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  31.33 
 
 		 329 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  31.33 
 
 		 329 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.81 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 355 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.03 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0351849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.11 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.33 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  29.85 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  32.83 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  30.03 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  29.63 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  29.32 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  31.38 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  33.94 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  36.57 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  29.39 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.66 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  28.4 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 		 352 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  27.27 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  28.31 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  27.27 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  28.44 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.48 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  27.05 
 
 		 341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  28.05 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  27.68 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  28.23 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 329 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01625  dihydroflavonol 4-reductase family protein  25.84 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.98 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0829  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>