More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0153 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
338 aa  691    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.18 
 
 
339 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  30.84 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
346 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.55 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.55 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.84 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.55 
 
 
335 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  31.41 
 
 
335 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.05 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.55 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.55 
 
 
338 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
352 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  31.59 
 
 
335 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
335 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
335 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.59 
 
 
335 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
335 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  31.43 
 
 
335 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
328 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  35.1 
 
 
332 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.04 
 
 
334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
348 aa  135  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
347 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  31.12 
 
 
336 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  30.12 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  29.97 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
349 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  36.27 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  36.27 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
363 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  30.61 
 
 
340 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30 
 
 
347 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  29.43 
 
 
340 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
342 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  31.42 
 
 
358 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  29.91 
 
 
363 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  27.93 
 
 
349 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  32.34 
 
 
333 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  30.33 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
361 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  32.84 
 
 
335 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
352 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
355 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  30.24 
 
 
329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
357 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  31.69 
 
 
332 aa  119  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
358 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  32.12 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  29.09 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  29.38 
 
 
328 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
329 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  28.79 
 
 
329 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
342 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  31.53 
 
 
345 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  29.76 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  29.27 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  29.79 
 
 
347 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.82 
 
 
327 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  30.56 
 
 
340 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  30.36 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
346 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  30.06 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  29.88 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  32.34 
 
 
336 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.91 
 
 
329 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  30.27 
 
 
341 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.58 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.58 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  33.2 
 
 
329 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  29.7 
 
 
329 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  29.7 
 
 
329 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
339 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
328 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
355 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
351 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
351 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
351 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  31.97 
 
 
336 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
347 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
347 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
324 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
332 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
322 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.56 
 
 
322 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  34.57 
 
 
335 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  27.25 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
346 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>