More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0685 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
348 aa  723    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.78 
 
 
348 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.42 
 
 
347 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.87 
 
 
349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.48 
 
 
346 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  59.06 
 
 
347 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 
352 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.38 
 
 
363 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  40.8 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  40.8 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  40.62 
 
 
357 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.29 
 
 
357 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.4 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  39.41 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  38.33 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.27 
 
 
355 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  35.57 
 
 
334 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 
347 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.26 
 
 
351 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
351 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
351 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  36.84 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  34.1 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 
332 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
319 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
325 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  36.44 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  36.03 
 
 
346 aa  162  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  37.69 
 
 
339 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
346 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  34.36 
 
 
346 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  37.93 
 
 
346 aa  152  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  32.45 
 
 
332 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
332 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  32.88 
 
 
343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.14 
 
 
341 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.14 
 
 
341 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  39.21 
 
 
334 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  36.54 
 
 
331 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  35.13 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  33.56 
 
 
328 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  34.78 
 
 
322 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  32.39 
 
 
335 aa  136  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  31.53 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  35.51 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  31.48 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  33.58 
 
 
328 aa  126  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  29.3 
 
 
336 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 
328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  33.6 
 
 
329 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  33.6 
 
 
329 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  29.69 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
333 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  32.94 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.57 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  29.48 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  29.65 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  31.35 
 
 
363 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  28.3 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
392 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  28.62 
 
 
340 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
355 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
335 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  30.31 
 
 
335 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
358 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
352 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  32.57 
 
 
328 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
313 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
328 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.59 
 
 
329 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  32.69 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  29.46 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  27.94 
 
 
329 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  33.88 
 
 
328 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  31.13 
 
 
329 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  30.72 
 
 
329 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  27.98 
 
 
329 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  27.98 
 
 
329 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
339 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.66 
 
 
322 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  28.53 
 
 
329 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  30.62 
 
 
336 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.49 
 
 
327 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  32.69 
 
 
336 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  31.35 
 
 
333 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
347 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
329 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  30.9 
 
 
354 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>