157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32463 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  100 
 
 
334 aa  676    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  63.28 
 
 
334 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  59.82 
 
 
336 aa  413  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  57.27 
 
 
336 aa  391  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  55.32 
 
 
335 aa  379  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  50.6 
 
 
335 aa  354  1e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  48.66 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  45.67 
 
 
339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  48.2 
 
 
336 aa  302  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  35.54 
 
 
334 aa  210  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  34.42 
 
 
346 aa  186  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  34.32 
 
 
346 aa  175  9e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  33.33 
 
 
346 aa  160  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  32.55 
 
 
343 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 
346 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  35.54 
 
 
347 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 
348 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
347 aa  126  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  32.78 
 
 
328 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
349 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.73 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.73 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
319 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
332 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  28.41 
 
 
332 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
352 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  33.33 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  33.33 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  30.42 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
363 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  30.77 
 
 
340 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
341 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  32.31 
 
 
357 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
347 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
357 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  28.28 
 
 
328 aa  106  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  30.77 
 
 
331 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
325 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  27.03 
 
 
341 aa  99  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  28.13 
 
 
358 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  27.3 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  29.2 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  27.88 
 
 
322 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  29.74 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  27.8 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  27.8 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  27.74 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  26.85 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
392 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.55 
 
 
327 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  29.39 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
322 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  27.8 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  28.3 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.6 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  26.14 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
347 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  25.83 
 
 
336 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.61 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  27.51 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.07 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  25.09 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  24.44 
 
 
363 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  24.09 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  26.1 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.4 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  26.1 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.19 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>