86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34974 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  100 
 
 		 336 aa  683    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  79.17 
 
 		 336 aa  557  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  68.45 
 
 		 335 aa  476  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  57.27 
 
 		 334 aa  391  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  53.64 
 
 		 334 aa  351  8e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  49.24 
 
 		 335 aa  325  8.000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  45.21 
 
 		 337 aa  301  7.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  42.86 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  42.39 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  38.86 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  35.99 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  36.09 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  36.18 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  32.26 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.1 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.1 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 348 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.97 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  29.97 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  31.18 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  29.63 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  30 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  27.45 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  28.81 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  27.58 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  27.58 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  27 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  28.45 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  29.92 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  27.87 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  23.43 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 339 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.61 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  26.04 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  25.66 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37466  predicted protein  29.38 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  25.84 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  25.84 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 392 aa  52.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  25.57 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.09 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  29.61 
 
 		 486 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1954  NAD dependent epimerase/reductase-related protein  25.67 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  53.19 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1706  serine 3-dehydrogenase  32.18 
 
 		 119 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  27.05 
 
 		 605 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  36.54 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.68 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.73 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 		 350 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.24 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>