More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE03550 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  100 
 
 
346 aa  707    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  76.01 
 
 
346 aa  555  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  56.36 
 
 
346 aa  384  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  44.08 
 
 
334 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  36.81 
 
 
334 aa  191  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  35.99 
 
 
339 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  35 
 
 
343 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  36.09 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  35.38 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  34.42 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  35.78 
 
 
335 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  34.32 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  34.32 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  32.45 
 
 
336 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
348 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  35.23 
 
 
347 aa  152  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.37 
 
 
352 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
348 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 
349 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
347 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  33.33 
 
 
354 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
352 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
342 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  31.62 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
346 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
346 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  35.31 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  35.93 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  35.93 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  34.23 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
319 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
357 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  30.7 
 
 
357 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  31.83 
 
 
358 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  29.97 
 
 
328 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
325 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
347 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  29.65 
 
 
328 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  32.35 
 
 
332 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  30.17 
 
 
357 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 
332 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.03 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.03 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  31.62 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
351 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
351 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
351 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  28.82 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  26.01 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  26.01 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  25.56 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.27 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  30 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  29.63 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  29.89 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  30.74 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.88 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  27.66 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  27.36 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  27.36 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  28.1 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  27.36 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  26.29 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.5 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.83 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.98 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.83 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  29.75 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.83 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  29.75 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  28.43 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  29.75 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.25 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  29.93 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>