More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6032 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  100 
 
 
363 aa  747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  90.06 
 
 
357 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  100 
 
 
363 aa  747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.35 
 
 
363 aa  737    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  90.62 
 
 
357 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  56.98 
 
 
352 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.33 
 
 
355 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  49.71 
 
 
354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  51.13 
 
 
358 aa  359  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  44.21 
 
 
349 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.8 
 
 
348 aa  236  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.11 
 
 
346 aa  216  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 
348 aa  212  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.15 
 
 
347 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
349 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.39 
 
 
347 aa  197  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 
352 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.97 
 
 
342 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 
346 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  34.63 
 
 
332 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  39.58 
 
 
340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
346 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 
351 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 
351 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.64 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  31.22 
 
 
334 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
325 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  32.6 
 
 
343 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  34.87 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.48 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.48 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  30.73 
 
 
346 aa  129  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  35.93 
 
 
346 aa  129  8.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  30.42 
 
 
346 aa  129  8.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.27 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  32.98 
 
 
331 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
347 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  30 
 
 
335 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
332 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  30.66 
 
 
328 aa  116  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  30.2 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  30.2 
 
 
329 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  30.86 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  33.46 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  34.15 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  29.43 
 
 
357 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  33.33 
 
 
334 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
332 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
341 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  28.65 
 
 
336 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
329 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
339 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
335 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
392 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  31.29 
 
 
328 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  33.33 
 
 
334 aa  102  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  28.47 
 
 
322 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  27.58 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  27.68 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  31.45 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  30.34 
 
 
329 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.31 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
329 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
313 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.07 
 
 
328 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
328 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
322 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
358 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
333 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  27.84 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  29.55 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.5 
 
 
322 aa  86.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  29.15 
 
 
328 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  29.76 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
355 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  29.46 
 
 
347 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.48 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  28.37 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  27.46 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  29.97 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  30.53 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  30.53 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  29.43 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01625  dihydroflavonol 4-reductase family protein  26.12 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.38 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>