More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1706 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1706  serine 3-dehydrogenase  100 
 
 
119 aa  235  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1418  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  70.69 
 
 
248 aa  169  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000653973  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  65.52 
 
 
248 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000194485  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0977  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  57.76 
 
 
248 aa  142  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.616956  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1376  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  52.54 
 
 
250 aa  135  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.85 
 
 
250 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0920  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.25 
 
 
249 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1181  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.31 
 
 
249 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4862  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.06 
 
 
254 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000522303  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
254 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000261149  unclonable  0.000000000503217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
255 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155421  hitchhiker  0.00000000000159857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
253 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 
251 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0557  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
254 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000797066  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0850  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.49 
 
 
249 aa  110  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
253 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2050  3-hydroxy acid dehydrogenase  51.79 
 
 
249 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1939  3-hydroxy acid dehydrogenase  49.11 
 
 
248 aa  110  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
255 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000309791  hitchhiker  0.00252207 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0971  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  46.85 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  52.38 
 
 
249 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  52.38 
 
 
249 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  47.32 
 
 
251 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
254 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2351  3-hydroxy acid dehydrogenase  49.11 
 
 
249 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64840  putative short-chain dehydrogenase  48.74 
 
 
253 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000142595  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  47.9 
 
 
253 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1893  3-hydroxy acid dehydrogenase  48.18 
 
 
249 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.86 
 
 
254 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1660  3-hydroxy acid dehydrogenase  48.21 
 
 
248 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00687336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1623  3-hydroxy acid dehydrogenase  48.21 
 
 
248 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1682  3-hydroxy acid dehydrogenase  48.21 
 
 
248 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97667  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1826  3-hydroxy acid dehydrogenase  48.21 
 
 
248 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0315451  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1614  3-hydroxy acid dehydrogenase  48.21 
 
 
248 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2119  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.54 
 
 
248 aa  103  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000142813  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1629  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.54 
 
 
248 aa  103  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.5514199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2290  3-hydroxy acid dehydrogenase  51.43 
 
 
249 aa  103  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
271 aa  103  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
251 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01498  L-allo-threonine dehydrogenase, NAD(P)-binding  45.54 
 
 
248 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000675994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.54 
 
 
248 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000149507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1748  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.54 
 
 
248 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01509  hypothetical protein  45.54 
 
 
248 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000865743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1626  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.54 
 
 
248 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0122  oxidoreductase  46.43 
 
 
253 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.49595  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2155  3-hydroxy acid dehydrogenase  44.64 
 
 
248 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000180953  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2130  3-hydroxy acid dehydrogenase  48.18 
 
 
249 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1701  3-hydroxy acid dehydrogenase  45.54 
 
 
248 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649919  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  45.05 
 
 
255 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
261 aa  99.4  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
254 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.07 
 
 
250 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
257 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.197802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.07 
 
 
250 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
256 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.08 
 
 
248 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0197  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.02 
 
 
254 aa  94.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.15 
 
 
253 aa  94.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
249 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.11 
 
 
253 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.75 
 
 
253 aa  93.6  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.48 
 
 
254 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.49 
 
 
267 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
257 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
250 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
256 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 
252 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
257 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0730  oxidoreductase protein  42.86 
 
 
262 aa  90.1  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 
250 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
248 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
248 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.3 
 
 
248 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
248 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 
248 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 
248 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
248 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 
256 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
248 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
248 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
248 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.19 
 
 
248 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  45.19 
 
 
248 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.19 
 
 
248 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.19 
 
 
248 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.19 
 
 
248 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.19 
 
 
248 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.19 
 
 
248 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  48.7 
 
 
251 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
253 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  37.07 
 
 
257 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 
248 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  43.1 
 
 
245 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0488  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.61 
 
 
253 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596302  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1968  glucose/ribitol dehydrogenase  40.95 
 
 
250 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140483 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
269 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
254 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  36.21 
 
 
257 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
250 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>