186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5194 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5194  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
316 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524902  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  85.11 
 
 
338 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.85 
 
 
322 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.85 
 
 
322 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.52 
 
 
322 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0770321  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
329 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
347 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
329 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
329 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
329 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.41 
 
 
343 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13757  oxidoreductase  40.87 
 
 
309 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.142095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
337 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
347 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
336 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  28.57 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  28.74 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  25.91 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  25.91 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  28.51 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.05 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.65 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  30.98 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  28.63 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  29.79 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  27.48 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.67 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.36 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.34 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  26.42 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  24.35 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.57 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  24.53 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  26.98 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  25.57 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
324 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0777  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  25.38 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
355 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.91 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
322 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.08 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.18 
 
 
335 aa  62.4  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  26.9 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.21 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  26.18 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  28.57 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
392 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  27.13 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.4 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  28.94 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  28.81 
 
 
336 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.21 
 
 
338 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.21 
 
 
338 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.21 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
358 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.21 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.21 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  27.8 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  24.46 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0829  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
339 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444894  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.55 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.27 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  27.27 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  27.5 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  27.5 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>