More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13757 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13757  oxidoreductase  100 
 
 
309 aa  626  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.142095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.04 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.04 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.04 
 
 
329 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.2 
 
 
347 aa  345  8e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.57 
 
 
329 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.37 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 
341 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 
338 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.8 
 
 
337 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.84 
 
 
343 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5194  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.87 
 
 
316 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524902  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5626  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0770321  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.45 
 
 
322 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.45 
 
 
322 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.85 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.02 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
340 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.8 
 
 
347 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
340 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  30.07 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
329 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  32.36 
 
 
340 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.67 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
330 aa  85.9  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
355 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  35.34 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  34.31 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.34 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  26.1 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  26.1 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  27.17 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  35.06 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  34.42 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  34.42 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
347 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  27.54 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.78 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  33.58 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  34.18 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.25 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  26.87 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  33.21 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  28.42 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  32.73 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  29.21 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  32.38 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.08 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  26.45 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  30.29 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  31.29 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.34 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  31.32 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  29.56 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  29.56 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  31.75 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.47 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.27 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.15 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0829  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  29.89 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>