283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6076 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
303 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
303 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.35 
 
 
303 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.73 
 
 
307 aa  328  7e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.2 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.88 
 
 
297 aa  288  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.2 
 
 
298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  50.34 
 
 
319 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.53 
 
 
301 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.39 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  38.62 
 
 
300 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.37 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  33.77 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  35.17 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  27.79 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
295 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
296 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 
293 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
295 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02506  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 
439 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0777894  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
312 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
295 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
291 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
298 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
286 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.55 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.55 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02225  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07170)  26.97 
 
 
342 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.439161  normal  0.578499 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01610  hypothetical protein  27.25 
 
 
364 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.529608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
294 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  30.72 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  26.8 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08988  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 
374 aa  92.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.956062  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
295 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
297 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.99 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
292 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
297 aa  86.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  27.42 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  32.2 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  29.7 
 
 
619 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
318 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.64 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02090  expressed protein  26.6 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.841584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.57 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.23 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
279 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  25.08 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  28.72 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  47.89 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  28.33 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.29 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.68 
 
 
350 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.16 
 
 
339 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>