36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01610 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK01610  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  748    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.529608  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  28 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02225  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07170)  30.32 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.439161  normal  0.578499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
298 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08988  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 
374 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.956062  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
301 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
307 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
303 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
303 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
297 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
303 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
299 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
319 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02506  conserved hypothetical protein  25.07 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0777894  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  27.04 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
296 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
295 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09152  conserved hypothetical protein  21.69 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  25.34 
 
 
303 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  24.28 
 
 
255 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
311 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
295 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.41 
 
 
310 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
294 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  25.67 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.56 
 
 
298 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>