More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4303 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
312 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.88 
 
 
295 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.56 
 
 
295 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  38.63 
 
 
300 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
286 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 
319 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
297 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  35.12 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 
293 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
297 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.9 
 
 
287 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
298 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
303 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.44 
 
 
292 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 
293 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
291 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  32.87 
 
 
316 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
291 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
298 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.53 
 
 
294 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 
296 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  31.45 
 
 
297 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 
295 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
302 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28888  predicted protein  29.49 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.760508  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
296 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  30.56 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
294 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.94 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.01 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.01 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00019  carnitine acetyl transferase (AFU_orthologue; AFUA_2G12530)  28.78 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  28.03 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.47 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.37 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
297 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  26.56 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  27.62 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  27.62 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  25.4 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  34.41 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
296 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
296 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
296 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.5 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  30.23 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  39.84 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  24.68 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  25.91 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  26.58 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  26.91 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.72 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  26.58 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.04 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  24.04 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  24.19 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  24.04 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  24.04 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  24.04 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  24.52 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  24.28 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>