95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2030 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  523  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.15 
 
 		 310 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 307 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 301 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 		 299 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 319 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 297 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  28.17 
 
 		 316 aa  89.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  34.31 
 
 		 295 aa  85.9  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 294 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  31.54 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.65 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.65 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.93 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  32.92 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  28.9 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  34.72 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.92 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 		 297 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  26.72 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02506  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 439 aa  68.6  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0777894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.42 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.42 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.6 
 
 		 321 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  27.32 
 
 		 313 aa  52.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 329 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 330 aa  49.7  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01610  hypothetical protein  24.28 
 
 		 364 aa  49.3  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.529608  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  23.31 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 311 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0028  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.29 
 
 		 330 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  26.48 
 
 		 361 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  26.88 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  26.88 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 		 309 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02225  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07170)  24.23 
 
 		 342 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.439161  normal  0.578499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.55 
 
 		 313 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  27.98 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.74 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0266  hypothetical protein  24.49 
 
 		 329 aa  42.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 		 351 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 		 328 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 		 318 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2363  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.92 
 
 		 324 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.0474481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>