More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3136 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 328 aa  658    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.39 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.77 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.7 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  33.61 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.86 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  30.22 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  30.91 
 
 		 345 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.72 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  31.05 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  31.52 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  30.58 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  23.24 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  31.16 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  31.16 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 310 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  31.41 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 		 353 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 311 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 352 aa  99  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  24.31 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  28.82 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  26.96 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  24.74 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.85 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  23.71 
 
 		 306 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  29.41 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.99 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  24.92 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  25.3 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  29.31 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  27.94 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.8 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  30.33 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  29.74 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  31.03 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  29.74 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.44 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  29.08 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  29.08 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  30.69 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.03 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.5 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  29.23 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.88 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.7 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  33.01 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.93 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.73 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  30.69 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.55 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6255  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.99 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  28.72 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.36 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.67 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  27 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.62 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.48 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.89 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.12 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.88 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>