98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4501 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 330 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.25 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.72 
 
 		 324 aa  235  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.19 
 
 		 327 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.73 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  42.04 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.84 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.46 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  31.23 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  31.12 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  30.86 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  30.84 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  30.84 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  30.46 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  30.84 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  30.88 
 
 		 345 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  36.52 
 
 		 331 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  37.87 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.66 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  34.04 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  25.78 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  31.09 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  25.22 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  25.33 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  25.14 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.95 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  23.83 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  25.41 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  28.17 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.25 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.25 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  26.36 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  28.63 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  32.84 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.01 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.4 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  27.57 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.48 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  22.27 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  28.11 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  28.11 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  27.03 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  21.82 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.01 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  23.44 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  27.87 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  27.57 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.46 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.43 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 271 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  24.86 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  25.95 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>