125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2374 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 326 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  86.2 
 
 		 326 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.42 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.98 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.43 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.62 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.01 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  41.05 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  25.33 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.17 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  26.77 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  26.82 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  26.82 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  26.82 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  29.45 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.53 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  26.62 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  28.08 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  28.77 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  24.81 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.67 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  25.62 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.66 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  25.31 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  24.12 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  26.03 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  25.67 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  25.59 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  26.04 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  21.22 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  24.06 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 317 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  25.23 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  29.81 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  21.83 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  27.56 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  22.22 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  25.41 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  24.6 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.17 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  25.23 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  25.67 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  24.6 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  25.29 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.65 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244527  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.61 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  25.13 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  25.13 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  23.53 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  26.17 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  28.3 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  27.65 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.74 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.54 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  25.33 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  22.22 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  25.48 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  28.32 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.14 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>