More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4240 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
327 aa  648    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  64.09 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.69 
 
 
338 aa  394  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.32 
 
 
350 aa  391  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.66 
 
 
342 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.57 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.89 
 
 
339 aa  338  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.88 
 
 
335 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.17 
 
 
339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  50 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.42 
 
 
326 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.64 
 
 
326 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 
336 aa  176  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
331 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 
310 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  33.33 
 
 
313 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 
313 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
309 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
310 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  34.03 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.49 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  29.24 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  28.08 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  40.95 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  28.88 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  21.07 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
746 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  20.66 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  21.76 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  23.53 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  24.79 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  32.41 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  32.41 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  33.33 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.01 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  32.41 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  30.99 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  31.48 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  29.59 
 
 
334 aa  62.8  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  20.82 
 
 
306 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
333 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  30.56 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  30.56 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.43 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  30.56 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.45 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  26.32 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  28.91 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  27.81 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  27.54 
 
 
336 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
305 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  26.95 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  31.17 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
301 aa  57  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.24 
 
 
296 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  28.99 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  27.05 
 
 
404 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.65 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  25.64 
 
 
295 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  29.34 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  28.4 
 
 
331 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.92 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  29.34 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.54 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  29.34 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.54 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0024  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>