130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2968 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 333 aa  677    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.25 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  43.16 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 		 338 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.02 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.12 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.24 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 		 346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  30.55 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  30.29 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  35.21 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  29.97 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  29.68 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  29.68 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  29.31 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  36.15 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  29.6 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  29.68 
 
 		 345 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.39 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  31.07 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  28.5 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  28.5 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  31.37 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  28.5 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  26.53 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  31.6 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.71 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  28.11 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  27.7 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  27.19 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.27 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 694 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  24.39 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  23.48 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  27.06 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.38 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  43.24 
 
 		 319 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  24.29 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  24.29 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  27.27 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  24.1 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  24.72 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  24.29 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  24.1 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  27.35 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  24.1 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  30.61 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>