More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0984 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
339 aa  692    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.89 
 
 
327 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.03 
 
 
335 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.54 
 
 
350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 
339 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
342 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.3 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.61 
 
 
338 aa  315  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  47.53 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 
333 aa  311  9e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.95 
 
 
326 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.36 
 
 
326 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
336 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  32.14 
 
 
313 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
310 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.71 
 
 
313 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  36.7 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  27.51 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.39 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  38.32 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  37.38 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  38.32 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 
746 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  35.78 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  35.78 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.67 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.79 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  34.86 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  25.83 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  34.86 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  25.2 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  23.93 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.73 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.6 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.12 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.65 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
321 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.61 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
308 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  24.1 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
298 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.09 
 
 
299 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
352 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
321 aa  62.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.2 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.09 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  25.97 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  22.18 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210493  normal  0.642206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.97 
 
 
281 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 
680 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  22.22 
 
 
694 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
307 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
320 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
341 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  22.01 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  21.2 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.64 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.26 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  24.17 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  25.32 
 
 
297 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.24 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 
331 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
350 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>