More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2251 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  95.37 
 
 		 281 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  57.6 
 
 		 299 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.25 
 
 		 291 aa  338  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  57.19 
 
 		 289 aa  335  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.42 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.42 
 
 		 291 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  48.4 
 
 		 313 aa  255  7e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.42 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.27 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.88 
 
 		 298 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  39.79 
 
 		 291 aa  212  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.96 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.08 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.11 
 
 		 291 aa  205  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0667  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.05 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.7 
 
 		 295 aa  201  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.18 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.55 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.06 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2721  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  40.42 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 345 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.24 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 332 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  33.02 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2433  putative oxidoreductase protein  35 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.706626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2860  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 		 345 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.9 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1965  hypothetical protein  32.92 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0794806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0272  hypothetical protein  32.92 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0481971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0876  hypothetical protein  32.92 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000605644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0949  hypothetical protein  32.92 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.61 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00471724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.61 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.61 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 		 362 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0830  hypothetical protein  30.98 
 
 		 341 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  30.96 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  31.38 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.1 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  33.94 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  34.38 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  32.27 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.89 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.63 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  33.48 
 
 		 289 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  32.88 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  29.12 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.39 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.48 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  25.35 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  26.62 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  26.6 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  27.76 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  25.45 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  27.11 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  30.39 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.67 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 294 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  27.62 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  30.05 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  30.05 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>