More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0365 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
333 aa  679    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  62.77 
 
 
329 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.55 
 
 
338 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.63 
 
 
350 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.57 
 
 
327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 
342 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.24 
 
 
335 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.73 
 
 
339 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  46.58 
 
 
327 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.83 
 
 
326 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 
326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.42 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
336 aa  159  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
331 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  32.79 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
311 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.96 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  28.45 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
746 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  34.27 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  29.15 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  27.93 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  27.49 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  20.08 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  27.53 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.26 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 
680 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.05 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.05 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  19.42 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.05 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.05 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.64 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.05 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
346 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  38.02 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  33.01 
 
 
345 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
368 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  28.38 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  33.01 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  33.01 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  33.01 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  33.01 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  33.01 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  33.01 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.72 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  31.9 
 
 
216 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  26.97 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  19.75 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  22.88 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
300 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  26.69 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  31.48 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  25.9 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  26.69 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
317 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  26.69 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  25.56 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  27.12 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  25.6 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  23.21 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  26.22 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
694 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.87 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.79 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
501 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
332 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>