More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0501 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  100 
 
 		 216 aa  425  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.55 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.07 
 
 		 219 aa  227  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  52.31 
 
 		 218 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  49.77 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  52.45 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.71 
 
 		 227 aa  217  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.47 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  39.73 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  39.73 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  37.62 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  37.13 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  37.56 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  42.58 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  36.89 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  39.73 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  42.33 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  36.95 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.91 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  43 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  38.46 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  42.03 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  38.21 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.81 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  37.16 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  37.04 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.05 
 
 		 270 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  32.77 
 
 		 257 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  34.98 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  34.98 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  37.56 
 
 		 257 aa  99  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  37.56 
 
 		 320 aa  98.6  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  36.97 
 
 		 332 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 		 238 aa  94.7  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  41.56 
 
 		 327 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  37.96 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  34.39 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.08 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  36.41 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  33.76 
 
 		 282 aa  92  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  36.81 
 
 		 297 aa  92  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 		 225 aa  91.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  34.82 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  36.82 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  40.52 
 
 		 323 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  40.52 
 
 		 323 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.91 
 
 		 291 aa  88.6  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  40.67 
 
 		 320 aa  88.2  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  40.88 
 
 		 339 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.55 
 
 		 328 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  36.84 
 
 		 306 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  36.54 
 
 		 321 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  38.67 
 
 		 320 aa  84.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  37.33 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  36.67 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  36.67 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.81 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  30.36 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  38.67 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.47 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  34.36 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.47 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.47 
 
 		 320 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  36.92 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  38.96 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  35.71 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  33.94 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  35.37 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  33.33 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  36.42 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.55 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  32.11 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  31.74 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  28.17 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  35.95 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  33.74 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  43.59 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  33.53 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>