135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2308 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 337 aa  665    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  65.27 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.97 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  48.34 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.74 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.19 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.43 
 
 		 346 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  43.09 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  37.29 
 
 		 345 aa  231  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  38.14 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  37.85 
 
 		 341 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  37.85 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  37.57 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  37.85 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  37.36 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.49 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.89 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  38.46 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.6 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  40.23 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.67 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  36.76 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.74 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 338 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 		 336 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.35 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.35 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  27.89 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  21.03 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.69 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  29.61 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  23.14 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  22.45 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  26.34 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  29.29 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.04 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  28.02 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  28.02 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  28.02 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  28.1 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  27.56 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  26.45 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  24.63 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  27.54 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  28.12 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  27.62 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  28.9 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  25.95 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2612  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.88 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1513  steroid dehydrogenase  26.72 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.43 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.28 
 
 		 387 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.12 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  23.67 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.15 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.47 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>