82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6880 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 324 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 		 333 aa  248  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.72 
 
 		 330 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.43 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.85 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  46.01 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  34.8 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  34.8 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  32.75 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  33.04 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  32.66 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  32.84 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  32.37 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  32.37 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.61 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.74 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.57 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  36.81 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  34.52 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.66 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  35.77 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  24.73 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  25.27 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  23.79 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  23.08 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  24.18 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  22.96 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  34.65 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  22.22 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  24.66 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 286 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  23.97 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  27.5 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  27.75 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  27.17 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  33.12 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  27.17 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  28.16 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  24.71 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  30.38 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  26.55 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  29.11 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  25.58 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  30 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  25.29 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  30.77 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  32.48 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.79 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>