94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 330 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  66.87 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.32 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.43 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.02 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.73 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  38.67 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  35.5 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.21 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  30.43 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  27.27 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  28.26 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  27.27 
 
 		 340 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  27.27 
 
 		 340 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  29.6 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  34.22 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 		 330 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  28.62 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  29.6 
 
 		 345 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 		 341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.27 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  35.53 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  27.67 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.86 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.11 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  21.74 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  21.78 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  21.33 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.87 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  21.51 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  21.72 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  21.33 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  21.5 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  21.11 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  23.41 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  22.93 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.2 
 
 		 376 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.92 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  19.64 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  26.47 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19154  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  21.12 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 		 694 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1513  steroid dehydrogenase  31.03 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  28.96 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  24.54 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2733  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.67 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.652066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  19.28 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.61 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.07 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  21.12 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  21.47 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.33 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 329 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>