More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7193 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 250 aa  484  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  38.3 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  36.09 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  39.91 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  39.58 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  39.58 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  39.58 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  40.42 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 237 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  39.41 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 258 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  33.61 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.743298  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  38.57 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  39.01 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  37.67 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01548  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_8G05590)  30.74 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.90356 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 		 285 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 288 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  32.81 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  34.12 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.47 
 
 		 309 aa  95.9  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 285 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  32.1 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.47 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1203  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>