More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1783 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 
250 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 
250 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.03 
 
 
249 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
263 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
250 aa  232  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
250 aa  231  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  46.91 
 
 
249 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  46.34 
 
 
249 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
248 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
252 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 
249 aa  222  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 
246 aa  222  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  45.31 
 
 
248 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
250 aa  215  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 
248 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
249 aa  212  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  45.08 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
259 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  47.28 
 
 
260 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
257 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
244 aa  209  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 
250 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  44.31 
 
 
249 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 
260 aa  207  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 
248 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  43.21 
 
 
250 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  45.12 
 
 
249 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  45.12 
 
 
249 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
258 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
249 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  47.18 
 
 
251 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
244 aa  205  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  44.4 
 
 
251 aa  205  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1738  short chain dehydrogenase  44.63 
 
 
278 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0147369  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 
253 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 
253 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 
250 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
249 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
244 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3696  short chain dehydrogenase  44.63 
 
 
278 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0367097  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  45.53 
 
 
248 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.95 
 
 
257 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  0.0943454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
249 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
244 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3249  short chain dehydrogenase  45.12 
 
 
249 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116631  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
248 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
247 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
258 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
246 aa  194  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.8 
 
 
251 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
254 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
258 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  45.12 
 
 
249 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
254 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
254 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
254 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
254 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
255 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
250 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
244 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
244 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4169  short chain dehydrogenase  44.21 
 
 
249 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00125324  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
254 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
256 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
250 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  42.68 
 
 
249 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
255 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
253 aa  188  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
249 aa  188  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
245 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
244 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  46.37 
 
 
244 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
244 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
249 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
249 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.743298  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
249 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
253 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
248 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>