More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3279 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.02 
 
 		 238 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.47 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.17 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 		 238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  41.28 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 240 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  41 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 238 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  41.81 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  38.7 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  33.04 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.268207  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  49.14 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.01 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  35.63 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000312486  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.85 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.443482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224503  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 250 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0824  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.54 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.394944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40900  putative short-chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>