More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3062 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
238 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.54 
 
 
238 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.17 
 
 
238 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
238 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
239 aa  171  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  40.59 
 
 
238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
237 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
237 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  44.77 
 
 
236 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  43.98 
 
 
240 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.11 
 
 
246 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  45.27 
 
 
240 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
245 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  44.54 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  44.54 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  44.54 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
237 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 
204 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
248 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
246 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 
238 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
245 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  31.51 
 
 
238 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
243 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  30.04 
 
 
222 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
238 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
250 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
250 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
241 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.81 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  48.28 
 
 
245 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  31.54 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.268207  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
258 aa  91.7  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
250 aa  89  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
259 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
248 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
245 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
250 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.439694  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815875  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  27.46 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.23 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
269 aa  82  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2069  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.29 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  33.33 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>