More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2988 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.98 
 
 
245 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.51 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.64 
 
 
244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
245 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  40.76 
 
 
238 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
243 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 
237 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  31.95 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
237 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  39.66 
 
 
237 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  38.24 
 
 
270 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 
240 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  33.04 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
237 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
242 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
237 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
238 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
236 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
240 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
238 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
246 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
238 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  28.81 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  27.97 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
239 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
259 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
258 aa  92  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
250 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
258 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
246 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  33.74 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  34.09 
 
 
250 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.268207  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
248 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.25 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  43.33 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3253  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.08 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.152872  normal  0.595682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  34.09 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.945101  normal  0.897274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501988  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
254 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3071  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1421  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.27 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>