More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1445 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 237 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  99.16 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  99.16 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  89.03 
 
 		 237 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  91.67 
 
 		 204 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  73.08 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  74.58 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  74.17 
 
 		 270 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  74.17 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  74.17 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  74.17 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  74.17 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  74.17 
 
 		 240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  73.33 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  65.38 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  60.94 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  44.26 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  40.57 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.54 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  39.13 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 240 aa  124  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 		 245 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  46.2 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  46.2 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  45.57 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 		 205 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.68 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.47 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.02 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.62 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.74 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12220  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 288 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.439694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.05 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.93 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315776  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  31.27 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 250 aa  91.7  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  29.69 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 		 265 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 273 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>