More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3655 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  42.67 
 
 
238 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  42.26 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
238 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  42.31 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  41.45 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  41.45 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  41.45 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  41.45 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 
237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 
245 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  41.88 
 
 
240 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  41.88 
 
 
240 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
237 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 
245 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  45.19 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  40.2 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
234 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  39.66 
 
 
237 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  39.66 
 
 
237 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  39.66 
 
 
237 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  44.93 
 
 
245 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
246 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  44.74 
 
 
246 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
245 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
238 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
255 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  34.21 
 
 
222 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
261 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 
250 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
253 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
237 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
237 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3225  bacilysin biosynthesis oxidoreductase BacC  36.18 
 
 
242 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
246 aa  98.6  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.86 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.6 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.57 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206772  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19021  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
253 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.71 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.95 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
245 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
245 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
252 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201742  hitchhiker  0.000163271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  32.26 
 
 
251 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
231 aa  93.2  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.268207  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  34.01 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
245 aa  92  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
254 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
248 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
246 aa  92  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  33.99 
 
 
286 aa  91.7  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  33.33 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>