More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0309 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206772  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
255 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
255 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
255 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
252 aa  168  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
253 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  39.22 
 
 
256 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
257 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 
253 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
253 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1466  short-chain alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 
267 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
245 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.51 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.71 
 
 
252 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
262 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
246 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2110  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
256 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
246 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
255 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
258 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
254 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
250 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
256 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
265 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  42.26 
 
 
253 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.29 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0876  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
250 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
246 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 
251 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  40 
 
 
253 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
252 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
252 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
253 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  40 
 
 
253 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
258 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
252 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
257 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.29 
 
 
249 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 
256 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
253 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
282 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3402  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.74 
 
 
252 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615434  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
248 aa  148  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
256 aa  148  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
251 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2853  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.77 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.4 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
251 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
246 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2175  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.36 
 
 
252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274234  hitchhiker  0.0000363255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
249 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
257 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1094  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.36 
 
 
252 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
262 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
245 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
267 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2616  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.76 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1358  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.69 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10933  conserved hypothetical protein  37.6 
 
 
287 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
250 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 
252 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
247 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1234  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 
252 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
251 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
244 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
252 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
251 aa  143  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
257 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
244 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1076  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
252 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0734  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
252 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2279  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
252 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
249 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1283  short-chain type dehydrogenase/reductase  35.02 
 
 
277 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
252 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
252 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1050  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.4 
 
 
249 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.16 
 
 
248 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
224 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  37.01 
 
 
259 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
249 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.506283  normal  0.100596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
255 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
253 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0816082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
244 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>