More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0876 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0876  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0734  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.65 
 
 
252 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1234  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.25 
 
 
252 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.25 
 
 
252 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1076  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.65 
 
 
252 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.65 
 
 
252 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.65 
 
 
252 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2279  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  93.65 
 
 
252 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0873  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  83.33 
 
 
252 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0691884  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2464  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  83.33 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2329  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  82.94 
 
 
252 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5746  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  81.35 
 
 
252 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00520623  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2423  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  81.75 
 
 
252 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1807  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  81.75 
 
 
252 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2419  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  81.75 
 
 
252 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1094  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  78.57 
 
 
252 aa  400  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3402  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  78.17 
 
 
252 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615434  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2175  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  78.57 
 
 
252 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274234  hitchhiker  0.0000363255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.83 
 
 
252 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.03 
 
 
252 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.03 
 
 
252 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0675  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  72.91 
 
 
253 aa  364  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228459  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2616  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.83 
 
 
252 aa  361  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.52 
 
 
253 aa  294  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1358  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.52 
 
 
255 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.33 
 
 
247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.97 
 
 
256 aa  284  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2289  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.52 
 
 
253 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3586  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.89 
 
 
253 aa  275  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4884  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.09 
 
 
261 aa  271  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.636092  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01763  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_6G09140)  51.59 
 
 
257 aa  268  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.134641  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.33 
 
 
249 aa  265  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.4 
 
 
250 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2853  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.8 
 
 
249 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2660  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.03 
 
 
256 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00127593  normal  0.0689416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0774  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.35 
 
 
246 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448664  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1050  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.94 
 
 
249 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0092  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.38 
 
 
253 aa  254  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2891  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.35 
 
 
242 aa  251  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000353377  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  50 
 
 
251 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.61 
 
 
249 aa  235  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1287  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.88 
 
 
252 aa  228  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1252  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.98 
 
 
248 aa  228  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0173112 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.42 
 
 
249 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1013  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.88 
 
 
252 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.42 
 
 
249 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.48 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
252 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  40.87 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09284  conserved hypothetical protein  36.08 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00149371  normal  0.454861 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
250 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
257 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
249 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
246 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
246 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  39.08 
 
 
266 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 
253 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
252 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
253 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
270 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
253 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
250 aa  158  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
252 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2879  putative alcohol dehydrogenase, zinc-independent  37.84 
 
 
265 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.575303  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.55 
 
 
255 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
256 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
256 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
254 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
248 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
248 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
251 aa  156  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
253 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
251 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 
253 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
254 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
254 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
255 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
255 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
253 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
261 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
251 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
290 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
249 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
259 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
259 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
252 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
269 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
259 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
249 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
256 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
259 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
259 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
258 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0435882  hitchhiker  0.0000139106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>