More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3295 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.44 
 
 
262 aa  319  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.98 
 
 
249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.38 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.01 
 
 
245 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
262 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
250 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
256 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
252 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.84 
 
 
249 aa  201  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.75 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
249 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.34 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  47.39 
 
 
253 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  42.46 
 
 
255 aa  194  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  46.99 
 
 
253 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
256 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  46.99 
 
 
253 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  191  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  46.59 
 
 
253 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  46.18 
 
 
253 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
250 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
252 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
265 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
282 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
252 aa  188  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  42.57 
 
 
256 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 
253 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  46.59 
 
 
253 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
251 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
253 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
256 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.66 
 
 
262 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
259 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
246 aa  184  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  42.29 
 
 
259 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.18 
 
 
244 aa  182  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
254 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
261 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.5 
 
 
247 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
253 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
252 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
251 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
246 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  42.46 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  43.6 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  45.85 
 
 
257 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
257 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
258 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
257 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
251 aa  178  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
255 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
287 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38962  normal  0.0399907 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
252 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
257 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  46.99 
 
 
253 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
251 aa  176  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
250 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
246 aa  175  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
261 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11085  conserved hypothetical protein  41.26 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  43.43 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0092  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.45 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.2 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
254 aa  171  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
246 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
283 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>