More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3817 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.24 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.63 
 
 		 254 aa  262  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  45.97 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  42 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 		 253 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 		 256 aa  185  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.68 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  44.94 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  42.45 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.17 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.46 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.2 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309971 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  39.76 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  38.82 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  39.37 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.3 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.65 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  41.83 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>