More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3801 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.68 
 
 
255 aa  267  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.26 
 
 
265 aa  244  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
252 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  48.61 
 
 
249 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
253 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  48.19 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
263 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
252 aa  230  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
277 aa  229  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0429275  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
256 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
252 aa  228  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
253 aa  227  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
250 aa  224  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
250 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  47.77 
 
 
256 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.08 
 
 
262 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
255 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  48.18 
 
 
251 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
250 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.42 
 
 
262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696289  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.11 
 
 
282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.56 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  49.17 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 
251 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.9 
 
 
246 aa  208  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 
272 aa  207  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
246 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  46.28 
 
 
253 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.16 
 
 
246 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
253 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  47.33 
 
 
253 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
249 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
252 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  46.28 
 
 
253 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 
257 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 
252 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
251 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
252 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
253 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
255 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
253 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  45.9 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
258 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
251 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
253 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  45.9 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  45.04 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  42.04 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.44 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00780913  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  42.56 
 
 
247 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
255 aa  194  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1081  oxidoreductase, putative short-chain alcohol dehydrogenase  45.6 
 
 
253 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
255 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
250 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
254 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
258 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
252 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.56 
 
 
254 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
255 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.186912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
282 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
252 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
257 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
258 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01006  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  44 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  46.69 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
259 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.98 
 
 
247 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2283  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  44.44 
 
 
251 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
246 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
253 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  42.08 
 
 
255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.98 
 
 
246 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
260 aa  178  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
254 aa  178  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
255 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  41.87 
 
 
257 aa  178  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
254 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
256 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>