More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2192 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  522  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.45 
 
 
257 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.13 
 
 
258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  57.87 
 
 
256 aa  311  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 
248 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 
282 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 
252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
253 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  50.2 
 
 
253 aa  248  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  49.39 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  48.58 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.43 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  48.58 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 
253 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  48.18 
 
 
253 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
255 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
255 aa  239  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  48.4 
 
 
253 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
251 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  48.37 
 
 
251 aa  231  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
255 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
251 aa  229  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1081  oxidoreductase, putative short-chain alcohol dehydrogenase  47.01 
 
 
253 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
255 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
256 aa  226  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
253 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
255 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2283  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  46.77 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
250 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
272 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  48 
 
 
253 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  43.27 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
263 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
258 aa  211  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
248 aa  211  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
252 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
258 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
258 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
250 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
254 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
250 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.32 
 
 
246 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
252 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
253 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  202  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
257 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01006  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  45.08 
 
 
255 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
265 aa  201  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
249 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
252 aa  201  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
258 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
258 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
253 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
321 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00780913  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
276 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
251 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 
254 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
265 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
252 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.17 
 
 
246 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 
254 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 
254 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
254 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
253 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.77 
 
 
246 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 
247 aa  191  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
255 aa  192  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
251 aa  191  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
251 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
264 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
252 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696289  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
252 aa  188  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
249 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
277 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0429275  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  39.11 
 
 
255 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
258 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
251 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  39.92 
 
 
262 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
270 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.309971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
253 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
272 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
272 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.13 
 
 
248 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
272 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.2 
 
 
247 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
252 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
255 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>