More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2059 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  504  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.26 
 
 
251 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 
250 aa  260  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
252 aa  255  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
252 aa  247  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.46 
 
 
251 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 
282 aa  241  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 
251 aa  241  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  53.23 
 
 
256 aa  238  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  50.4 
 
 
252 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
251 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  46.43 
 
 
255 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
255 aa  227  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
253 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
250 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  47.58 
 
 
249 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
262 aa  225  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696289  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
250 aa  224  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 
251 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  48 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
252 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.58 
 
 
246 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
246 aa  208  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.58 
 
 
246 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
277 aa  208  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0429275  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.56 
 
 
250 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
248 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 
250 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.93 
 
 
262 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
282 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
253 aa  201  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
252 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.98 
 
 
321 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00780913  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  44.35 
 
 
253 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 
265 aa  193  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
271 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
253 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
256 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
253 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
251 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
258 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
249 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 
253 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
254 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
262 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 
253 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
253 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
263 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  42.11 
 
 
247 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
255 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  41.53 
 
 
247 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
264 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
272 aa  181  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
248 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
255 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
257 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
249 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
256 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
252 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
248 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
254 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
249 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
251 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
260 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
256 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
247 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
249 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.31 
 
 
255 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
258 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  40.7 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
256 aa  171  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
258 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
267 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
259 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1600  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
248 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
251 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.88 
 
 
272 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
260 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
250 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
255 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
255 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
255 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
253 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
258 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>