More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0865 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  99.61 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  99.21 
 
 		 254 aa  503  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  93.31 
 
 		 254 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  66.93 
 
 		 255 aa  333  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 		 255 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  67.45 
 
 		 255 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  66.93 
 
 		 255 aa  327  9e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  68.53 
 
 		 258 aa  326  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  66.01 
 
 		 254 aa  321  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  65.22 
 
 		 254 aa  321  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3234  short chain dehydrogenase  68.4 
 
 		 257 aa  305  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.458923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  62.85 
 
 		 254 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  61.26 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2587  short chain dehydrogenase  68.4 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3492  short chain dehydrogenase  62.02 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  59.2 
 
 		 252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  58 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  54.03 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0751  short chain dehydrogenase  56.19 
 
 		 250 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450614  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2039  short chain dehydrogenase  55.75 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  50.81 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  43.62 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 330 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3474  glucose 1-dehydrogenase  98.89 
 
 		 92 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 248 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 250 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  39.76 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  39.76 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  39.76 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  40.8 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  39.36 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  40.4 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.58 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.57 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  40.4 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  38.96 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  40 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  37.55 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  40 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.39 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  41.27 
 
 		 261 aa  161  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.49 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  37.35 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  37.35 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.51 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>