More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1402 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.72 
 
 
249 aa  427  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  51.22 
 
 
247 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  51.22 
 
 
247 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
246 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.81 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.81 
 
 
246 aa  241  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
253 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.98 
 
 
250 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  47.6 
 
 
251 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  44.8 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
252 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
257 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  41.7 
 
 
261 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  40.89 
 
 
261 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
271 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  40.89 
 
 
261 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  41.3 
 
 
261 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  41.3 
 
 
261 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  40.49 
 
 
261 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
251 aa  191  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  46.15 
 
 
256 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  40.49 
 
 
261 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
252 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43336  Glucose 1-dehydrogenase peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase  43.78 
 
 
253 aa  191  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  40.89 
 
 
261 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
255 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  40.08 
 
 
261 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.56 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
250 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  40.08 
 
 
261 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
272 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
246 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.33 
 
 
246 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
260 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
252 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
252 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
302 aa  186  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
246 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
246 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
246 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
268 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
246 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
246 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
246 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
255 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
253 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.46 
 
 
247 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
257 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  38.87 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  39.3 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.51 
 
 
246 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.56 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  41.04 
 
 
256 aa  181  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
270 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
264 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
257 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.28 
 
 
247 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
254 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
250 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  44 
 
 
254 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 
255 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  40.08 
 
 
261 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
257 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.04 
 
 
255 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
266 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.51 
 
 
246 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
252 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
257 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  37.45 
 
 
269 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
254 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
255 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  43.53 
 
 
257 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
257 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 
246 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
247 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.09 
 
 
246 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
250 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
250 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.59 
 
 
246 aa  175  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
258 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
268 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.32 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
312 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>