More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1734 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  100 
 
 
249 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  69.48 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  58.87 
 
 
254 aa  268  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  54.55 
 
 
254 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 
253 aa  244  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  53.2 
 
 
255 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  53.2 
 
 
255 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  51.21 
 
 
254 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  50.81 
 
 
254 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  50.81 
 
 
254 aa  234  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3234  short chain dehydrogenase  52.85 
 
 
257 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.458923  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  50 
 
 
254 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3492  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 
256 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  48.03 
 
 
255 aa  228  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 
258 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2587  short chain dehydrogenase  53.25 
 
 
257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  54.1 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  49.21 
 
 
255 aa  225  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  47.18 
 
 
254 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  47.58 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0751  short chain dehydrogenase  51.8 
 
 
250 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450614  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2039  short chain dehydrogenase  51.35 
 
 
250 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
248 aa  175  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
282 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.89 
 
 
252 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
251 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
250 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
251 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
256 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
251 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.09 
 
 
256 aa  158  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
252 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
256 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
253 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.6 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
249 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.06 
 
 
248 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
251 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
258 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
251 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
249 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  39.43 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
257 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.46 
 
 
251 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
267 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  36.18 
 
 
247 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
246 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.62 
 
 
246 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
252 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
254 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
254 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  35.63 
 
 
247 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.14 
 
 
259 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
258 aa  148  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 
246 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  36.55 
 
 
261 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
252 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
253 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.96 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 
253 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
312 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
250 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
254 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
253 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
252 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
276 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.21 
 
 
246 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.51 
 
 
249 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
250 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
249 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.51 
 
 
262 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  37.6 
 
 
261 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  37.2 
 
 
261 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
249 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  37.2 
 
 
261 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
253 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  37.2 
 
 
261 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  36.55 
 
 
261 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  37.2 
 
 
261 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
253 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  36.14 
 
 
261 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>